一转眼八年时间过去了，在大崩坏的危机结束后，99%的崩坏都被封印在了月球之中，从那一刻开始“崩坏”这一伴随着文明而生的灾难，终于划上了句号。但这个世界上仍存在着极少量的未被封印的崩坏，还在这世间继续游荡，在暗中威胁着人类。为应对残存的崩坏，在天命新任主教德丽莎的指示下，天命组织改组昔日的女武神部队为“天命特别行动队”，到世界各地清除那些隐藏着的崩坏。而我，亚当，就是由天命四大S级女武神之一的“雷电芽衣”直接领导的下属第三小队中的一员，也是圣芙蕾雅学院第一位男性学员。